Από τις 30 Νοεμβρίου 2024, ο Οργανισμός Φυσικού Περιβάλλοντος και Κλιματικής Αλλαγής, ο οποίος υπάγεται στο υπουργείο Περιβάλλοντος και Ενέργειας, ανακάλεσε την οικοδομική άδεια για τα έργα αποκατάστασης του ιστορικού συμπλέγματος ιδιωτικού ιερού ναού, πύργου και αγροικίας της εταιρείας ΖΑΝΤΕ Marathonisi, που βρίσκεται στο Μαραθωνήσι Ζακύνθου, στον κόλπο του Λαγανά.
Η ανάκληση της άδειας προήλθε λόγω της ανακολουθίας που διαπιστώθηκε μεταξύ της οικοδομικής άδειας και των απαγορευτικών διατάξεων του Εθνικού Πάρκου Ζακύνθου. Είχε προηγηθεί ενημέρωση του ΟΦΥΠΕΚΑ από την εταιρεία στις 13 Νοεμβρίου σχετικά με την επικείμενη έναρξη εργασιών, και στις 15 του μήνα διαπιστώθηκε ότι ο φάκελος της άδειας ήταν ελλιπής, καθώς έλειπαν κρίσιμες γνωμοδοτήσεις, όπως η μελέτη φωτισμού και η εκτίμηση περιβαλλοντικών επιπτώσεων.
Καθώς τα κατασκευαστικά υλικά και μηχανήματα βαρέος τύπου μεταφέρονταν στη νησίδα για τις οικοδομικές εργασίες, ο ΟΦΥΠΕΚΑ απέστειλε νέα επιστολή για την άμεση παύση των εργασιών, ενημερώνοντας παράλληλα όλες τις αρμόδιες υπηρεσίες. Η υπόθεση έχει προσελκύσει την προσοχή των αστυνομικών αρχών της Ζακύνθου, οι οποίες ζήτησαν να ελεγχθεί η νομιμότητα των εργασιών.
Μέχρι σήμερα, η οικοδομική άδεια δεν έχει ανακληθεί και οι εργασίες στο Μαραθωνήσι συνεχίζονται. Ο Υπουργός Περιβάλλοντος και Ενέργειας έδωσε εντολή για την εξέταση της υπόθεσης από την Εθνική Αρχή Διαφάνειας, προκειμένου να διαπιστωθεί αν έχουν τηρηθεί οι νόμιμες διαδικασίες.
Οι περιβαλλοντικές οργανώσεις, όπως η MEDASSET και η WWF Greece, έχουν καταγγείλει τις οικοδομικές εργασίες στην προστατευόμενη νησίδα, υποστηρίζοντας ότι οι εργασίες περιλαμβάνουν την κατάπλευση οχηματαγωγού σκάφους και την κατασκευή εξέδρας στην παραλία, παραβιάζοντας έτσι τις διατάξεις προστασίας της περιοχής.
Η νησίδα του Μαραθωνησίου, που βρίσκεται εντός του Εθνικού Θαλάσσιου Πάρκου Ζακύνθου, έχει οικολογική σημασία και προστατεύεται από το προεδρικό διάταγμα που είναι σε ισχύ.